Desmond Miles après
avoir retrouver la Pomme d'Éden caché
par son ancêtre Ezio Auditore da
Firenze.
Dans l'Animus Ezio retrouve
la mémoire du Sujet 16 qui
lui explique se trouver dans la Chambre noire de
l'animus.
Desmond retourne donc dans les mémoires
d'Ezio maintenant âgé de 52 ans en 1511, qui cherche les secret du grand maitre
assassin Altaïr Ibn-La'Ahad à Masyaf.
Il découvre une pièce secrète dans la bibliothèque de
Masyaf qui contient des reliques pouvant inverser les forces pour son combat
contre les Templiers, il
se rend donc à Constantinople alors
capitale de l'Empire Ottoman pour
retrouver les 5 clés qui
ouvriront le repaire.
Ton voyage commence dans le laboratoire de la cellule des Assassins Russe où le père de Desmond confia les plans de l'Animus qu'il à volé à Abstergo.
Ton voyage se terminera, à Constantinople.
En récompense l'armure d'Isahak Pacha au carrefour des civilisations ...la sagesse divine.